De UU is onderverdeeld in de volgende faculteiten:
- Faculteit Bètawetenschappen
- Faculteit Diergeneeskunde
- Faculteit Geesteswetenschappen
- Faculteit Geowetenschappen
- Faculteit Recht, Economie, Bestuur en Organisatie
- Faculteit Sociale Wetenschappen
- Faculteit Geneeskunde / Universitair Medisch Centrum
De UU stelt zichzelf de volgende taken:
- Het academisch vormen van jonge mensen;
- Het opleiden van nieuwe generaties onderzoekers;
- Het opleiden van academici die kennis combineren met professionele vaardigheden;
- Het doen van grensverleggend onderzoek;
- Het bijdragen aan oplossingen voor maatschappelijke vraagstukken.